一是鼓励自主创新，强化植物新品种保护，禁止和打击假冒侵权的原则。二是理顺育种创新体制机制，加强支持基础性、前沿性和公益性育种研究的原则。三是发挥种子企业的市场主体地位，引导和扶持其做大做强的原则。四是保障种业安全和生物安全的原则。五是建立市场导向下的全程监管原则。
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